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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
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Data corrente: |
19/10/2017 |
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Data da última atualização: |
19/10/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
JOAQUIM, L. B.; NASCIMENTO, G. B. do; MARCHESI, J. A. P.; SAVEGNAGO, R. P.; CANTAO, M. E.; LEDUR, M. C.; MUNARI, D. P. |
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Afiliação: |
LETÍCIA BORGES JOAQUIM, UNESP/Jaboticabal; GUILHERME BATISTA DO NASCIMENTO, UNESP/Jaboticabal; JORGE AUGUSTO PETROLI MARCHESI, USP; RODRIGO PELICIONI SAVEGNAGO, UNESP/Jaboticabal; MAURICIO EGIDIO CANTAO, CNPSA; MONICA CORREA LEDUR, CNPSA; DANÍSIO PRADO MUNARI, UNESP/Jaboticabal. |
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Título: |
Estudo dos segmentos de homozigose em uma população de suínos. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 12., 2017, Ribeirão Preto. Anais... Ribeirão Preto: SBMA, 2017. 1 CD-ROM. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Resumo: Marcadores do tipo SNP (Polimorfismo de nucleotídeo único) são úteis em estudos de estrutura da população e conservação genética, permitindo obter informações sobre a história de uma população e parentesco entre seus indivíduos. Para investigar o histórico de seleção de uma linhagem comercial materna de suínos, 300 fêmeas e 25 machos foram analisados utilizando um painel de SNPs de 60K para a detecção de segmentos de homozigose (ROH, do inglês Runs of Homozygosity) com alta frequência populacional. As regiões de ROH em mais de 30% dos animais foram investigadas para identificar possíveis regiões conservadas. Um grande número de ROHs longos (> 5Mb) foi encontrado podendo indicar recentes eventos de endogamia na população estudada. Nas regiões de homozigose com frequência maior que 30% foram identificados 240 genes, dos quais alguns estão descritos como envolvidos na expressão de características reprodutivas e de comportamento. Logo, o presente estudo reforça a eficácia na utilização de dados de ROH para o estudo do histórico de seleção em populações animais, e sugere que os ancestrais da população estudada possivelmente foram submetidos a seleção direta ou indireta para características reprodutivas e comportamentais. Abstract: Single nucleotide polymorphism (SNP) markers are useful to study population structure and conservation genetics, which allows assessing information about population history and the relationship among individuals. To investigate the population history, 300 females and 25 males from a commercial maternal pig line were analyzed using genomic data to detect runs of homozygosity (ROH). The ROH regions present in more than 30% of the samples were investigated to identify possible conserved regions. A large number of long ROHs (> 5Mb) were found and might indicate recent inbreeding events in the studied population. In the homozygous regions with frequency greater than 30% 240 genes were identified, which some of them were described affecting behavioral and reproductive traits. Therefore, the study showed evidence that the ancestors of the studied population have undergone direct or indirect selectionfor behavior and reproduction traits. MenosResumo: Marcadores do tipo SNP (Polimorfismo de nucleotídeo único) são úteis em estudos de estrutura da população e conservação genética, permitindo obter informações sobre a história de uma população e parentesco entre seus indivíduos. Para investigar o histórico de seleção de uma linhagem comercial materna de suínos, 300 fêmeas e 25 machos foram analisados utilizando um painel de SNPs de 60K para a detecção de segmentos de homozigose (ROH, do inglês Runs of Homozygosity) com alta frequência populacional. As regiões de ROH em mais de 30% dos animais foram investigadas para identificar possíveis regiões conservadas. Um grande número de ROHs longos (> 5Mb) foi encontrado podendo indicar recentes eventos de endogamia na população estudada. Nas regiões de homozigose com frequência maior que 30% foram identificados 240 genes, dos quais alguns estão descritos como envolvidos na expressão de características reprodutivas e de comportamento. Logo, o presente estudo reforça a eficácia na utilização de dados de ROH para o estudo do histórico de seleção em populações animais, e sugere que os ancestrais da população estudada possivelmente foram submetidos a seleção direta ou indireta para características reprodutivas e comportamentais. Abstract: Single nucleotide polymorphism (SNP) markers are useful to study population structure and conservation genetics, which allows assessing information about population history and the relationship among individuals. To investigate the population hi... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Linhagem; Melhoramento genético animal; Polimorfismo; Reprodução animal; Suíno. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/165273/1/final8631.pdf
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Marc: |
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520 $aResumo: Marcadores do tipo SNP (Polimorfismo de nucleotídeo único) são úteis em estudos de estrutura da população e conservação genética, permitindo obter informações sobre a história de uma população e parentesco entre seus indivíduos. Para investigar o histórico de seleção de uma linhagem comercial materna de suínos, 300 fêmeas e 25 machos foram analisados utilizando um painel de SNPs de 60K para a detecção de segmentos de homozigose (ROH, do inglês Runs of Homozygosity) com alta frequência populacional. As regiões de ROH em mais de 30% dos animais foram investigadas para identificar possíveis regiões conservadas. Um grande número de ROHs longos (> 5Mb) foi encontrado podendo indicar recentes eventos de endogamia na população estudada. Nas regiões de homozigose com frequência maior que 30% foram identificados 240 genes, dos quais alguns estão descritos como envolvidos na expressão de características reprodutivas e de comportamento. Logo, o presente estudo reforça a eficácia na utilização de dados de ROH para o estudo do histórico de seleção em populações animais, e sugere que os ancestrais da população estudada possivelmente foram submetidos a seleção direta ou indireta para características reprodutivas e comportamentais. Abstract: Single nucleotide polymorphism (SNP) markers are useful to study population structure and conservation genetics, which allows assessing information about population history and the relationship among individuals. To investigate the population history, 300 females and 25 males from a commercial maternal pig line were analyzed using genomic data to detect runs of homozygosity (ROH). The ROH regions present in more than 30% of the samples were investigated to identify possible conserved regions. A large number of long ROHs (> 5Mb) were found and might indicate recent inbreeding events in the studied population. In the homozygous regions with frequency greater than 30% 240 genes were identified, which some of them were described affecting behavioral and reproductive traits. Therefore, the study showed evidence that the ancestors of the studied population have undergone direct or indirect selectionfor behavior and reproduction traits.
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Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 28 | |
| 2. |  | FORNARI, M. B.; NEIS, K. L.; MARCHESI, J. A. P.; LEDUR, M. C.; SOCCOL, V. T.; PEIXOTO, J. de O. Association of the A211G polymorphism in the bone sialoprotein gene with skeletal structure in a paternal broiler line. In: WORLD´S POULTRY CONGRESS, 24., 2012, Salvador. Abstract... Salvador: WSPA, 2012. 1 CD-ROM. World's Poultry Science Journal, v. 68, supl. 1, 2012. Projeto/Plano de Ação: 02.10.06.003.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 3. | | NEIS, K. L.; FORNARI, M. B.; MARCHESI, J. A. P.; FONGARO, G.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C. Associação de um marcador molecular no gene da Grelina com características de integridade óssea em frangos de corte. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA EMBRAPA , 5., 2011, Concórdia. Resumos. Concórdia: Embrapa Suínos e Aves, 2011. p. 23 . JINC. Projeto/Plano de Ação: 06.09.06.001.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 4. | | MARCHESI, J. A. P.; FORNARI, M. B.; NEIS, K. L.; TESSMANN, A. L.; LEDUR, M. C.; PEIXOTO, J. de O. Associação do marcador molecular LEPR1 A>G com características de integridade óssea em frangos de corte. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA EMBRAPA , 5., 2011, Concórdia. Resumos. Concórdia: Embrapa Suínos e Aves, 2011. p. 22 . JINC. Projeto/Plano de Ação: 02.10.06.003| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 6. | | ROSA, J. O.; SAVEGNAGO, R. P.; MARCHESI, J. A. P.; CRUZ, V. A. R. da; LEDUR, M. C.; MUNARI, D. P. Análise de componentes principais dos valores genéticos para peso corporal e de órgãos de aves de corte. In: CURSO DE INVERNO DE GENÉTICA, 7., FACAV-UNESP, 2016. Publicado: Ciência & Tecnologia: Fatec-JB, Jaboticabal, v. 8, n. 1, 2016. Número especial 2.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 7. | | CRUZ, V. A. R. da; IBELLI, A. M. G.; MARCHESI, J. A. P.; PANDOLFI, J. R. C.; PEIXOTO, J. de O.; MUNARI, D. P. Associação do receptor da adiponectina com cortes nobres e características relacionadas à deposição de gordura em uma linhagem paterna de frangos de corte. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 10., 2013, Uberaba. Anais... Belo Horizonte: SBMA, 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 8. | | JOAQUIM, L. B.; NASCIMENTO, G. B. do; MARCHESI, J. A. P.; SAVEGNAGO, R. P.; CANTAO, M. E.; LEDUR, M. C.; MUNARI, D. P. Estudo dos segmentos de homozigose em uma população de suínos. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 12., 2017, Ribeirão Preto. Anais... Ribeirão Preto: SBMA, 2017. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 9. | | CARVAJAL, A. B.; MARCHESI, J. A. P.; BERNARDES, P. A.; CANTAO, M. E.; PEIXOTO, J. de O.; FIGUEIREDO, E. A. P. de; LEDUR, M. C.; MUNARI, D. P. Estrutura populacional de uma linha paterna de frangos de corte usando análise de registros de pedigree. In: CURSO DE INVERNO DE GENÉTICA, 7., FACAV-UNESP, 2016. Publicado: Ciência & Tecnologia: Fatec-JB, Jaboticabal, v. 8, n. 1, 2016. Número especial 2.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 10. | | MARCHESI, J. A. P.; IBELLI, A. M. G.; PALUDO, E.; TAVERNARI, F. de C.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C. Expressão do gene receptor da leptina (LEPR) em frangos de corte normais e afetados pela necrose da cabeça do fêmur. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 8., 2014, Concórdia. Anais... Brasília: Embrapa, 2014. p. 43-44 JINC 2014.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 11. | | PETRY, B.; ZANELLA, R.; IBELLI, A. M. G.; MARCHESI, J. A. P.; PANDOLFI, J. R. C.; LEDUR, M. C.; PEIXOTO, J. de O. Comparação de métodos de homogeneização celular e congelamento para extração de RNA. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA (JINC), 7., 2013, Concórdia. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2013. p. 13-14.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 12. | | TESSMANN, A. L.; MARCHESI, J. A. P.; ZANELLA, R.; CANTAO, M. E.; PANDOLFI, J. R. C.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C. Mining for polymorphisms in the CALB gene and its associations with performance and carcass traits in a paternal broiler line. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 59., 2013, Águas de Lindóia. Resumos... Ribeirão Preto: SBG, 2013. p. 149.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 13. | | TREVISOL, I. M.; CARON, L.; MORES, M. A. Z.; RECH, D. V.; ZANI, G. da S; BACK, A.; MARCHESI, J. A. P.; ESTEVES, P. A. Pathogenicity of GI-23 avian infectious bronchitis virus strain isolated in Brazil. Viruses, v. 15, n. 5, p. 1200, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 14. | | NEIS, K. L.; FORNARI, M. B.; IBELLI, A. M. G.; MARCHESI, J. A. P.; TESSMANN, A. L.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C. Prospecção de SNPs em um fragmento do gene da osteonpontina em frangos de corte. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 6.; SEMINÁRIO INTEGRADO DE PESQUISA E EXTENSÃO DA UnC, 2., 2012, Concórdia. Anais... Concórdia: Embrapa Suínos e Aves, 2012. p. 44. JINC. SIPEX. Projeto/Plano de Ação: 02.10.06.003.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 15. | | MARCHESI, J. A. P.; NEIS. K. L.; FORNARI, M. B.; IBELLI, A. M. G.; PANDOLFI, J. R. C.; LEDUR, M. C.; PEIXOTO, J. de O. Prospecção de SNPs no gene calbidina e distribuição genotípica do polimorfismo CALB A>G em uma linhagem de frangos de corte. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 6.; SEMINÁRIO INTEGRADO DE PESQUISA E EXTENSÃO DA UnC, 2., 2012, Concórdia. Anais... Concórdia: Embrapa Suínos e Aves, 2012. p. 45. JINC. SIPEX. Projeto/Plano de Ação: 02.10.06.003.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 16. | | NEIS, K. L.; IBELLI, A. M. G.; MARCHESI, J. A. P.; KAWSKI, V. L.; FORNARI, M. B.; LOPES, L. dos S.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C. A SNP in the BMP3 gene associated with carcass traits in broilers. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 58., 2012, Foz do Iguaçu. Resumos... Foz do Iguaçú: SBG, 2012. p. 187| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 17. | | MARCHESI, J. A. P.; IBELLI, A. M. G.; PALUDO, E.; TAVERNARI, F. de C.; PEIXOTO, J. de O.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. Validation of housekeeping genes for gene expression analysis of bone broilers samples using real-time PCR. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 60., 2014, Guarujá. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2014. p. 28.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 18. | | MARCHESI, J. A. P.; IBELLI, A. M. G.; CANTAO, M. E.; ZANELLA, R.; SETTLES, M. L.; PEIXOTO, J. de O.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. Whole transcriptome analysis of pectoralis major muscle reveals differences in calcium signaling pathway between white striping affected and unaffected broilers. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 61., 2015, Águas de Lindóia. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 19. | | MARCHESI, J. A. P.; ONO, R. K.; IBELLI, A. M. G.; BUZANSKAS, M. E.; CANTAO, M. E.; PEIXOTO, J. de O.; MUNARI, D. P.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. Estudo de associação global do genoma revela novos genes e regiões genômicas associadas à conversão alimentar em frangos de corte. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 12., 2017, Ribeirão Preto. Anais... Ribeirão Preto: SBMA, 2017. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 20. | | MARCHESI, J. A. P.; ONO, R. K.; CANTAO, M. E.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; MOREIRA, G. C. M.; GODOY, T. F.; COUTINHO, L. L.; MUNARI, D. P.; LEDUR, M. C. Exploring the genetic architecture of feed efficiency traits in chickens. Scientific Reports, v. 11, n. 4622, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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